安装R与Rstudio

R 语言的下载与安装

  1. 前R官方网站https://www.r-project.org；
  2. 选择一个镜像网站，比如，https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN；
  3. Windows用户，选择”Download R fro Windows”，再选择”base”, 下载Download R-4.2.1 for Windows；
  4. Mac用户，选择”Download R for macOS”，如果是M1或M2处理器，下载R-4.2.1-arm64.pkg；其它处理器，下载R-4.2.1.pkg。
  5. 双击安装即可；
  6. 检查是否安装成功，可以查看电脑中是否存在”R Console”这个软件，R不同于一般软件，其主要是一种语言和操作环境，对没有编程经验的同学很难理解这句话，通俗地说，可以将R理解为可以实现特定功能的命令集，安装在电脑中的某个位置，调用这些命令一般需要一个界面GUI，这就是”R Console”，R Console是官方GUI，但其功能有限，有很多替代方案，其中，Rstudio是最为优秀一个。打开R Console主要是检查R成功安装在你的电脑上。
  7. 可以在R Console中，在符号>后输入　plot(pressure) ，如果出现一个散点图，说明R可以正常运行。

Rstudio的下载与安装

Rstudio是使用R语言时非常优秀的交互界面，也是一款开源软件。其有两种选择Rstudio Desktop 和Rstudio Server,两者在功能上几乎没有区别，前者安装在本地，后者是安在远程服务器。我们选择Rstudio Desktop，有两个不同版本，Open Source Edition和 Pro Edition，后者可以提供官方帮助和商业许可，二者之间的功能差异不大，我们选择Open Source Edition.

  1. 官方下载地址：https://www.rstudio.com/products/rstudio/download/
  2. 选择Mac 或者Windows版本；
  3. 双击安装；
  4. 打开Rstudio；

Rstudio 简介

窗口简介

Alt

  • Source: 写代码、文档、浏览数据；

  • Console: 显示代码运行结果，即时运行代码。

  • Environment: 显示R对象；)

  • Files: 管理文件及文件夹；

  • Plots: 显示图形结果

  • Packages: 下载、更新和启用packages，

  • Viewer: 动态文档显示的地方；

  • Presentation: 显示PPT的地方；

理解project

  1. project是用来管理文件的，管理与某个项目相关的各种文件，包括data、script、 rmarkdown、图像和文字。
  2. project本质上是一个文件夹；
  3. project有两点好处：使得与一个项目有关的文件有条理地放在一起；容易存储、调用各种文件；

生成一个project:

  1. file > new project > new directory > new project, 给project选择一个名称（文件名不用有空格和特殊符号），确定存储的位置；
  2. 在上述名称的文件夹下有一个”project_name.Rproj”的文件产生；
  3. Rstudio右上角有一个专门管理project的窗口，在此可以新建、打开project，也可以对project进行配置；

理解package

Package是R发挥特定功能的子集。R package 分为两类，一类是R语言自身包含的package,它包括R语言的核心功能和基础功能，这包括stats、graphics、grDevices、datasets、utils、methods、base。另一类package是第三方的package。第三方packages来自于非官方的个人或者组织。这类package占R功能的大多数。Package的存在实现了R语言功能的模块化和开源。模型块化是指R语言使用者可以根据自己的需要安装相应的Package, 开源是指任何有一定编程基础的人都可以给R语言提供新的功能，这也是R语言比其它商业软件强大的地方，开源使其功能变得越全面、越强大、越优化。

如何下载、安装package：

  1. 安装第三方package,有两种方式。来源于cran官方第三方package. 使用install.package("readr") ,需要特别注意的括号内的package 名称必须用引号。

  2. 已经安装的package可以右侧的Packages面板中显示；

  3. 另一类package，没有进入cran审核，保存在其它位置，比如，install.packages("easystats", repos = "https://easystats.r-universe.dev")

  4. 很多最新的package在进入cran之前，保存在github.com，这里需要使用install_github()，install_github() 是devtools包中的命令。另外，即使进入cran的package，其最新版也会保存在github.com,这时也可以用install_github()来安装，比如devtools::install_github("tidyverse/dplyr") .install_github()里面是最新版package的安装路径，这个路径一般包括两部分，用/分开，前面一般是软件开发者在github的用户名，如tidyverse，后面则是package的名称，比如readr。这个路径一般可以在两个地方找到，一是pacakge的官网，比如dplyr的官网https://dplyr.tidyverse.org，还有就是这个package源文件所在的github存放所在地，比如dplyr的源文件地址https://github.com/tidyverse/dplyr。官网和源文件地址可通过检索引擎查找。

  5. 在使用install_github()之前，还需要对系统环境进行配置，需先运行devtools::has_devel() ，如果不通过，请查看https://rstats.wtf/set-up-an-r-dev-environment.html。

  6. packages的启用，base package不用单独启用，可以直接调用；但是第三方package使用之前需要调用，调用命令library(readr),括号内的package名称可以不加引号。已经启用的packages在Packages面板中list中的左侧方框中打钩显示。

  7. 更新package. 使用devtools::update_packages("pkgname")，或者使用Packages窗口。

如何熟悉一个package

一般情况下，package都有一个官方网站，比如dplyr package的官方网站为https://dplyr.tidyverse.org，这是了解和学习某一package最好的资源，这包括功能简介、如何上手、命令手册、专题指南、更新日志和源代码等信息。

重要的Rstudio setup

  • Rstudio > preferences > options > general > basics > save workspace to . RData on exit： 选择never。

  • Rstudio > preferences > options > Packages > Mangement > primary CRAN repository： 选一个中国的镜像。

  • Rstudio的重启：Session > restart R

  • Preference > General >Graphics, 设置Backend为AGG 。